Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nell2Q61220 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nell2Q61220 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nell2Q61220 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nell2Q61220 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms