Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Arhgef1Q61210 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Arhgef1Q61210 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Arhgef1Q61210 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Arhgef1Q61210 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms