Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lamb3Q61087 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lamb3Q61087 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lamb3Q61087 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms