Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Meis1Q60954 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Meis1Q60954 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Meis1Q60954 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms