Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d1Q60949 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d1Q60949 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d1Q60949 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms