Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klf4Q60793 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klf4Q60793 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klf4Q60793 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms