Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cdkn2cQ60772 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdkn2cQ60772 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cdkn2cQ60772 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms