Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn11Q60771 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn11Q60771 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn11Q60771 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms