Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sik1Q60670 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Sik1Q60670 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sik1Q60670 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sik1Q60670 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sik1Q60670 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms