Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr2f1Q60632 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2f1Q60632 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms