Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uimc1Q5U5Q9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uimc1Q5U5Q9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uimc1Q5U5Q9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms