Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Scaf1Q5U4C3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Scaf1Q5U4C3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Scaf1Q5U4C3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Scaf1Q5U4C3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms