Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubr3Q5U430 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubr3Q5U430 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubr3Q5U430 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubr3Q5U430 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms