Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mks1Q5SW45 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mks1Q5SW45 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mks1Q5SW45 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mks1Q5SW45 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms