Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVR0

Tbc1d9b, TBC1 domain family member 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9bQ5SVR0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d9bQ5SVR0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tbc1d9bQ5SVR0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9bQ5SVR0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms