Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmn1r196Q5SVD5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vmn1r196Q5SVD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn1r196Q5SVD5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms