Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sft2d1Q5SSN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sft2d1Q5SSN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms