Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam46cQ5SSF7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam46cQ5SSF7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam46cQ5SSF7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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