Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf215Q5SPX3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf215Q5SPX3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf215Q5SPX3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf215Q5SPX3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.4 ms