Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrc3Q5DU56 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nlrc3Q5DU56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nlrc3Q5DU56 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms