Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmtc2Q56A06 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmtc2Q56A06 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmtc2Q56A06 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmtc2Q56A06 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.6 ms