Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm14685Q52KH6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm14685Q52KH6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm14685Q52KH6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms