Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rhox3aQ4TU90 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhox3aQ4TU90 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhox3aQ4TU90 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms