Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm10488Q4KL05 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm10488Q4KL05 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm10488Q4KL05 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms