Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne3Q4FZC9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Syne3Q4FZC9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne3Q4FZC9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms