Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5935Q497S0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5935Q497S0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5935Q497S0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1596 ms