Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2K7

1700123L14Rik, RIKEN cDNA 1700123L14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123L14RikQ3V2K7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
1700123L14RikQ3V2K7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
1700123L14RikQ3V2K7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700123L14RikQ3V2K7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700123L14RikQ3V2K7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms