Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc43Q3V0L5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc43Q3V0L5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lrrc43Q3V0L5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
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