Protein–RNA interactions for Protein: Q3V053

4933427I04Rik, Riken cDNA 4933427I04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933427I04RikQ3V053 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
4933427I04RikQ3V053 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933427I04RikQ3V053 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4933427I04RikQ3V053 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4933427I04RikQ3V053 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms