Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttc9Q3V038 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttc9Q3V038 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc9Q3V038 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms