Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc160Q3UYG1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc160Q3UYG1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc160Q3UYG1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms