Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd3l2Q3UXB0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3l2Q3UXB0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mbd3l2Q3UXB0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms