Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defb48Q3UW22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Defb48Q3UW22 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defb48Q3UW22 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms