Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lgr6Q3UVD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr6Q3UVD5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr6Q3UVD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr6Q3UVD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms