Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc51Q3URS9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc51Q3URS9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc51Q3URS9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc51Q3URS9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms