Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp30Q3UN04 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp30Q3UN04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp30Q3UN04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp30Q3UN04 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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