Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cln5Q3UMW8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Cln5Q3UMW8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cln5Q3UMW8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cln5Q3UMW8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.8 ms