Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hdgfl2Q3UMU9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hdgfl2Q3UMU9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hdgfl2Q3UMU9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms