Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMQ8

Naf1, H/ACA ribonucleoprotein complex non-core subunit NAF1, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Naf1Q3UMQ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Naf1Q3UMQ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Naf1Q3UMQ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Naf1Q3UMQ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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