Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem241Q3UME2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmem241Q3UME2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms