Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Washc4Q3UMB9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Washc4Q3UMB9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Washc4Q3UMB9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Washc4Q3UMB9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms