Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upf3bQ3ULL6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upf3bQ3ULL6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upf3bQ3ULL6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms