Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc61Q3UJV1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc61Q3UJV1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc61Q3UJV1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms