Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpr55Q3UJF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpr55Q3UJF0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr55Q3UJF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr55Q3UJF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr55Q3UJF0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr55Q3UJF0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpr55Q3UJF0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms