Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHN9

Ndst1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst1Q3UHN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndst1Q3UHN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ndst1Q3UHN9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ndst1Q3UHN9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ndst1Q3UHN9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms