Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LchnQ3UHG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LchnQ3UHG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LchnQ3UHG7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms