Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrc58Q3UGP9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrc58Q3UGP9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrc58Q3UGP9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms