Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Rsph3aQ3UFY4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rsph3aQ3UFY4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rsph3aQ3UFY4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms