Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Yipf3Q3UDR8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Yipf3Q3UDR8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Yipf3Q3UDR8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms