Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssbp4Q3U4B1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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